广西首起新冠奥密克戎变异株引起的本土聚集性疫情病例新冠病毒基因特征分析

摘要：

目的 揭示2022年2月广西德保县本土新冠疫情中病例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组特征及变异情况,为广西新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情溯源及防控工作提供科学依据.方法 从广西德保县2月本土新冠疫情的确诊病例中选取30份病例的上呼吸道标本进行核酸提取、构建DNA测序文库、第二代测序仪上机测序、拼接测序数据,通过基因比对和构建进化树完成病毒基因变异位点和进化分析.结果 与武汉参考株相比,广西德保县2月本土聚集性新冠疫情病例的SARS-CoV-2核苷酸突变中位数为57个(56～58个),氨基酸突变的中位数为63个(62～65个),同源性非常高,均属于VOC/Omicron变异株BA.1进化分支.结论 SARS-CoV-2全基因组测序分析对新冠疫情的溯源研判提供科学依据,对新冠疫情的防控至关重要.

关键词：新型冠状病毒、Omicron变异株、本土聚集性疫情、基因组变异特征、氨基酸变异特征、系统进化分析

所属期刊栏目：23

分类号：R563.1(呼吸系及胸部疾病)

资助基金：广西重点研发计划;广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题

在线出版日期：2023-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：568-572