新疆维吾尔族胃癌合并幽门螺旋杆菌感染患者差异表达基因分析

摘要：

目的 分析研究维吾尔族胃癌合并幽门螺旋杆菌感染患者差异表达基因,筛选胃癌发生发展过程中的关键基因和信号通路.方法 对2017年1-12月新疆维吾尔自治区人民医院的5名维吾尔族胃癌合并幽门螺旋杆菌感染患者胃癌组织和癌旁组织进行基因芯片检测,获取胃癌合并幽门螺旋杆菌感染的基因表达谱,并进行差异表达基因筛选.采用基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析了解差异基因的功能,并通过STRING数据库和Cytoscape分析差异基因编码蛋白之间的互作网络进一步筛选调控关键基因,qRT-PCR对挑选的基因进行表达量验证分析.结果 通过比较分析胃癌组织和癌旁组织芯片数据,共筛选出差异表达基因919个(P＜0.05,Foldchange≥2),其中上调251个,下调668个.GO分类注释显示,差异基因与胃酸分泌、甲状腺激素代谢、氧化还原酶活性、细胞稳态、磷脂易位、鞘磷脂代谢等生物功能存在密切关联.KEGG通路分析显示,细胞周期、P53信号通路、Nothch信号通路、鞘糖脂生物合成、DNA复制、错配修复、细胞粘附分子、脂肪消化吸收等信号通路可能在胃癌合并幽门螺旋杆菌感染过程中发挥着重要的调控作用.通过构建蛋白质相互作用网络筛选出的Hub基因有ITGAM、C3AR1、CCL4、CD86、ITGB2、MTHFR、UGT1A1等.qRT-PCR结果显示挑选验证基因表达趋势和基因芯片结果一致.结论 本研究建立了维吾尔族胃癌合并幽门螺旋杆菌感染患者基因表达谱,筛选并分析了相关差异表达基因,获得了与胃癌合并幽门螺旋杆菌感染密切相关的潜在候选基因,为临床诊断、治疗提供参考.

关键词：胃癌、幽门螺旋杆菌、基因芯片、差异表达

所属期刊栏目：23

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金2018D01C124

在线出版日期：2023-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：179-183,后插1-后插2