10.3969/j.issn.1672-3619.2023.02.002
LncRNA-NR_046269对马尔尼菲篮状菌感染人支气管上皮细胞早期CLTC基因表达的影响
目的 研究马尔尼菲篮状菌(TM)感染人支气管上皮细胞BEAS-2B早期,长链非编码RNA(lncRNA)-NR_046269对网格蛋白重链基因(CLTC)表达的影响.方法 分析前期TM孢子感染BEAS-2B细胞4 h后的lncRNA-mRNA基因芯片表达谱.以BEAS-2B细胞为研究对象,分为实验组和空白对照组,实验组用TM孢子感染BEAS-2B细胞4h,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测lncRNA-NR_046269、CLTC的相对表达量.通过生物信息学分析lncRN A-NR_046269与CLTC mRN A的相关性,然后使用慢病毒载体转染BEAS-2B细胞,分别过表达和敲低lncRNA-NR_046269(分为过表达组和敲低组),验证lncRNA-NR_046269对CLTC的表达是否具有靶向调控作用.结果 与空白对照组相比,实验组 lncRNA-NR_046269[(1.05±0.06)vs.(37.17±0.46)]和CLTC[(1.02±0.01)vs.(4.44±0.45)]的表达显著上调,差异均有统计学意义(t=121.49、12.89,P均<0.05),RT-qPCR结果与基因芯片结果一致.生物信息学分析提示NR_046269与CLTCmRNA成显著正相关(PCC=0.987,P<0.05).成功构建稳定过表达和敲低lncRNA-NR_046269的BEAS-2B细胞株,与阴性对照组(0.865±0.328)相比,过表达组中NR_046269表达上调(10.570±0.250),CLTC 的表达随着上调(1.250±0.020),同时敲低组中 NR_046269 下调(0.020±0.001),CLTC 表达亦下调(0.008±0.002),差异均有统计学意义(F=4 994.44、3 617.74,P均<0.05).结论 TM感染支气管上皮细胞早期lncRNA-NR_046269和CLTC表达显著上调,且lncRNA-NR_046269对CLTC基因有正性调控作用,揭示了 TM感染进展中的功能性炎症相关lncRNA及基因,可能作为TM治疗新的潜在靶点.
马尔尼菲篮状菌、人支气管上皮细胞、lncRNA-NR_046269、CLTC、慢病毒转染
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R519(传染病)
国家自然科学基金82160001
2023-04-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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