长链非编码RNA和mRNA在乳腺癌中的差异表达

摘要：

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)在乳腺癌中的差异表达情况.方法 组织样本采集于2018年9-11月,来自于新疆医科大学附属肿瘤医院.选取5例经病理诊断结果确认为乳腺癌的肿瘤组织及5例经病理证实无肿瘤侵犯的乳腺癌旁正常组织(癌旁组织).采用博奥晶典长链非编码RNA芯片V4检测乳腺癌组织和癌旁组织lncRNA和mRNA的差异表达.结果 相对于癌旁组织,乳腺癌组织中差异表达上调的lncRNA有551个,下调的lncRNA有959个,乳腺癌组织中差异表达前5位的lncRNA分别是XR_159043.1、TCONS_00013634、uc003gdg.1、TCONS_00009203、TCONS_00016441.在 mRNA表达谱芯片中,相对于癌旁组织,乳腺癌差异表达上调的mRNA有529个,下调的mRNA有1 129个;乳腺癌组织中差异表达前5位的mRNA分别是LEP、PLIN1、ADIPOQ、PRSS56、HEPACAM.根据所得差异表达的mRNA,通过基因本体论(GO)的数据库,疾病的富集分析可以观察到,富集到的疾病包括免疫系统疾病、获得性免疫缺陷综合征(AIDS)、肿瘤、中枢神经系统肿瘤等.富集到的京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路包括磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、非受体酪氨酸激酶-信号转导及激活转录因子(Jak-STAT)信号通路、Ras信号通路、叉头框蛋白O(FoxO)信号通路.结论 通过lncRNA芯片技术筛选出与乳腺癌相关的lncRNA与mRNA,为下一步探究lncRNA和mRNA在乳腺癌中的作用机制奠定了研究基础.

关键词：长链非编码RNA、信使RNA、乳腺癌、差异表达

所属期刊栏目：22

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金2017D01C379

在线出版日期：2023-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1636-1640,封4