间充质干细胞调控的慢加急性肝衰竭小鼠肝脏转录组景观

摘要：

目的 通过检测和分析间充质干细胞(MSC)治疗的慢加急性肝衰竭(ACLF)小鼠肝脏转录组学,探究重要差异基因集合及其生物学效应.方法 使用生理盐水或MSC治疗四氯化碳诱导的ACLF小鼠.转录组测序获得肝脏差异表达基因(DEGs).进行功能富集分析、蛋白相互作用网络分析、免疫浸润分析及加权基因共表达网络分析.最终构建枢纽基因与表型网络.结果 经或未经MSC治疗的ACLF小鼠肝脏(n=6)表达谱显示出584个DEGs(lg|FC|≥3,Q≤0.05).DEGs主要富集在钙信号、细胞因子-细胞因子受体相互作用和白细胞介素-17(IL-17)信号等通路(Q≤0.05).鉴定出一个以IL-6为中心的含41个基因的免疫调控网络,其与肝脏巨噬细胞(Spearson cor=0.496)、中性粒细胞(Spearson cor=-0.421)、滤泡辅助 T 细胞(Spearson cor=0.401)和辅助性 T 细胞 17(Th17)(Spearson cor=-0.342)比例变化相关.共表达的DEGs分为7个模块(|Pearson cor|≥0.8,Q≤0.05),功能主要为调控细胞增殖、免疫与炎症、氧化还原过程、糖脂代谢等.结论 本研究揭示了参与MSC阻断ACLF进展的候选枢纽基因和通路,为全面地了解MSC治疗ACLF的分子机制提供帮助.

关键词：慢加急性肝衰竭、间充质干细胞、二代测序、转录组学、生物信息学

所属期刊栏目：22

分类号：R575.3(消化系及腹部疾病)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广东省自然科学基金

在线出版日期：2022-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1179-1184,封2