两种烟曲霉基因分型方法的比较研究

摘要：

目的 筛选一种操作简单、分辨率高的烟曲霉基因分型方法.方法 选取分离自14例慢性肺曲霉病(CPA)患者的31株烟曲霉,同时用两种基于串联重复序列[改良烟曲霉短串联重复序列(改良STRAf)和表面蛋白编码基因外显子的串联重复序列(TRESP)]的方法进行基因分型,用NCSS 11软件绘制树状图,比较两种方法的分型效果.结果 改良STRAf方法共鉴定出23种基因型,其中MC3是分辨率最高的基因,共鉴定出14个等位基因;TRESP方法共鉴定出18种基因型,MP2、CSP、CFEM最常见的基因型分别为m1.1、t03、c08A,其中MP2是分辨率最高的基因,共鉴定出8个等位基因;菌株11、13的改良STRAf分型结果一致,但CSP基因存在一个短串联重复序列(STR)差别;菌株23与M患者分离菌株的TRESP分型一致,但其改良STRAf方法多个基因的STR数存在差别.结论 TRESP的分辨率略低于改良STRAf方法,但其不依赖于仪器,适合在临床实验室推广使用.

关键词：烟曲霉、基因分型、短串联重复序列

所属期刊栏目：21

分类号：R379.6(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广东省自然科学基金;宝安区医疗卫生基础研究项目;南方医科大学深圳医院国自然培育计划;南方医科大学深圳医院"苗苗"培育计划启动项目;南方医科大学深圳医院重点学科建设基金科研提升计划

在线出版日期：2021-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：691-694,734