弓形虫乳酸脱氢酶2结构与功能的生物信息学分析

摘要：

目的 预测在NCBI Protein文库中登录号为AAC46863的弓形虫乳酸脱氢酶2(LDH2)蛋白序列的结构和功能特征及其在免疫诊断和疫苗研究方面的应用前景.方法 利用NCBI和ExPaSy等生物信息学网站在线分析工具和MEGA7及Vector NTI等软件包,分析弓形虫LDH2的理化性质、结构与功能特征.结果 在线软件ProParam分析该蛋白由326个氨基酸构成,平均亲水系数(GRAVY):0.095,可能为疏水性蛋白.SignalP 4.1 Server预测无信号肽,为非分泌型蛋白.NetPhos 3.1预测该蛋白有21个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点14个,苏氨酸磷酸化位点6个,酪氨酸磷酸化位点1个.经Vector NTI软件包多序列比对,发现弓形虫有一段特异于人、鼠、牛等其他物种的氨基酸序列TGMPEGKALD.分别用ABCpred Prediction Server、SYFPEITHI软件预测该段特异序列很可能为线性B、T细胞表位.结论 弓形虫LDH2存在较多的磷酸化位点以及一段特异的氨基酸序列,且该段特异氨基酸序列很可能为线性B、T细胞表位,提示LDH2在弓形虫病的免疫诊断和疫苗研究方面有较好的应用前景.

关键词：弓形虫、乳酸脱氢酶、生物信息学、免疫诊断、疫苗

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分类号：R382.5(医学寄生虫学)

资助基金：国家重点研究和发展项目2016YFC1202005;国家自然科学基金81641094;广东省自然科学基金S2012010008504

在线出版日期：2019-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：809-812,后插2