柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR的建立

摘要：

目的 建立柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR,用于手足口病例快速诊断及监测.方法 根据GenBank中柯萨奇A组6型病毒VP1高保守序列设计引物和探针,建立和优化实时荧光RT-PCR反应体系,评估其特异性、灵敏度、稳定性,在手足口病监测中应用,并与商品化试剂比较,抽取部分阳性标本测序验证.结果 本研究建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR可在60 min内完成检测,与其它型别的肠道病毒和病原体无交叉反应,灵敏度可达100 copies/μL梯度,对两个不同核酸浓度样本Ct值的变异系数分别为0.29%、0.38%.280份非EV71、CA16的标本中检出142份CA6阳性标本,与商品化试剂检测结果一致.随机抽取15份阳性标本产物测序,与CA6靶基因序列同源性99.8%以上.结论 建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR方法特异、灵敏、稳定,可用于非EV71、非CA16的其它肠道病毒标本分型.

关键词：手足口病、柯萨奇A组6型病毒、实时荧光RT-PCR

所属期刊栏目：17

分类号：R373.2+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2017-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：908-911