联合PCR技术克隆白纹伊蚊漆酶型酚氧化酶基因及其生物信息学分析

摘要：

目的 测定白纹伊蚊漆酶型酚氧化酶的基因的全长序列并用生物信息学方法分析其结构和功能.方法 从白纹伊蚊卵、幼虫、蛹、雌蚊、雄蚊中提取总RNA,逆转录后以总cDNA为模板,设计简并引物进行巢式PCR,扩增部分序列后设计新的特异性引物补全5'端序列,使用3'-RACE法补全3'端序列,拼接全长后进一步进行生物信息学分析.结果 通过巢式PCR扩增出1 145 bp的核苷酸序列,测序后设计5'端序列的下游引物,扩增出约900 bp的核苷酸序列,设计3'端的上游引物,配合3'RACE试剂盒扩增出约600 bp的核苷酸序列,寻找重复序列将三段序列进行拼接,得到国内外从未获得的长2 244 bp、编码747个氨基酸序列的白纹伊蚊漆酶型酚氧化酶基因的全长序列.生物信息学分析其与白纹伊蚊的相似性最高,为含信号肽的跨膜蛋白,含3个Cu氧化酶超家族位点,属于蓝色多铜氧化酶家族.结论 联合PCR技术的应用使较长长度的基因序列的扩增更为方便、准确.为进一步对其进行功能的研究奠定了基础.

关键词：巢式PCR、3’RACE、白纹伊蚊、漆酶型酚氧化酶

所属期刊栏目：11

分类号：Q554.9(酶)

资助基金：国家自然科学基金青年基金项目30800110;教育部博士点新教师基金200805581108

在线出版日期：2011-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：500-504