利用基因表达谱提取乳腺癌细胞分化相关特征基因

摘要：

目的 利用基因芯片数据挖掘识别与乳腺癌组织学分级相关的特征基因,对乳腺癌的临床诊断和生物医学研究起到借鉴和参考作用.方法 从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)获得乳腺癌芯片表达数据,利用支持向量机提取获得不同组织学分级的肿瘤样本的特征基因,并对这些基因进行生物学功能分析.结果 获得了64个特征基因,分类正确率达到100%,这些基因与癌症有较大的相关性,主要集中在转录调控、离子运输、器官发生发育等多个生物学途径中.结论 通过对基因芯片数据的挖掘,可以从全局上了解肿瘤的表达情况,加深对乳腺癌细胞分化分子机制的认识.

关键词：表达谱、乳腺癌、组织学分级、支持向量机、特征基因

所属期刊栏目：10

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：广东省生物芯片重点实验室基金2004B60144

在线出版日期：2010-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：377-379,393