鼻咽癌EMT相关基因的筛选及生物信息学分析

摘要：

目的 利用生物信息学方法 挖掘鼻咽癌上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)发生的潜在分子机制.方法 从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中寻找并下载鼻咽癌的相关基因芯片数据,并使用Genclip软件对下载的数据进行分析,寻找鼻咽癌公共基因芯片数据中与EMT相关的基因,并用生物信息学方法 对筛选出来的基因作进一步分析.结果 在公共的鼻咽癌芯片数据中找到35个与EMT相关的差异表达基因,这些基因功能大致与细胞组分、细胞粘附、通信、信号转导、分化、运动、迁移以及细胞表面受体相关的信号转导等有关,这些功能往往都被认为与肿瘤的侵袭和转移有关.结论 利用生物信息学的方法 能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息.鼻咽癌EMT是由于多种基因表达改变所致,这为确定鼻咽癌早期转移诊断标志与预后的预示开辟了新的思路.

关键词：鼻咽癌、EMT、生物信息学、GEO

所属期刊栏目：10

分类号：R739.62;R739.63(肿瘤学)

在线出版日期：2010-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：367-371