分子遗传学数据分析和处理平台的设计与实现

摘要：

目的 开发一个在高性能计算机的Linux环境下运行,基于B/S模式的分子遗传学数据分析与处理平台.方法 以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言整合许多遗传学数据分析软件和工具包,针对不同的SNPs变异数据,以提示方式简化数据输入格式和参数设置,经平台处理的结果以表格、文本或图像格式输出.结果 该平台实现了连锁不平衡的计算和绘制、挑选标签SNP和疾病对照设计或传递不平衡设计的关联分析,以及对一些群体遗传数据的估计等功能,操作简单,数据分析速度快.结论 该平台作为一个整合的遗传学研究辅助工具,克服了当前遗传分析软件或工具包在操作使用方面的不足,为遗传学研究者提供方便.目前该平台正处于测试阶级,运行状态良好.

关键词：SNPs、遗传变异、关联分析、群体遗传、生物信息学

所属期刊栏目：8

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

在线出版日期：2008-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：225-228