亚洲带绦虫肌动相关蛋白2/3复合体结构与功能的生物信息学分析

摘要：

目的 分析和预测亚洲带绦虫肌动相关蛋白2/3复合体亚单位4(Actin related protein 2/3 complex subunit 4,Atp2/3)基因及其编码蛋白的结构和特性.方法 利用美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其它生物信息学分析软件包,如Pcgene和Vector NTI suite,从亚洲带绦虫全长cDNA质粒文库中识别Arp2/3基因及其编码区,分析、预测该基因编码蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等.结果 该基因全长718 bp,编码区为30-530,编码167个氨基酸,为全长基因.GenBank中与日本血吸虫Arp2/3氨基酸序列一致性达78%,相似性达90%.理论分子量为19533.9.没有跨膜区和各种亚细胞序列.预测3个主要的抗原表位为53～58,74～82,138～143均在Arp2/3空间结构的分子表面.结论 应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出Arp2/3基因.

关键词：亚洲带绦虫、Arp2/3、cDNA、生物信息

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分类号：R383.32(医学寄生虫学)

资助基金：国家自然科学基金30760227;贵州省科技攻关项目黔科合NY字20063037

在线出版日期：2008-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1056-1059