广西南丹县旋毛虫COX1基因和5S rRNA基因分析

摘要：

目的 分析广西壮族自治区南丹县旋毛虫(Trichinella spiralis)COX1和5SrRNA基因特点,阐述该分离株的系统发生关系及基因变异规律.方法 PCR扩增南丹旋毛虫分离株COX1和5S rRNA基因片段并对扩增产物进行测序;应用Blast和Clustal X软件计算其碱基组成,分析该分离株与GenBank中相应序列的同源性及遗传距离,同时应用UPGMA方法分析聚类关系.结果 扩增后COX1基因片段长419 bp.5S rRNA基因片段长695 bp.南丹旋毛虫分离株与Trichinella spiralis(T.spiralis)的同源性最高,分别为99.0%和99.1%,遗传距离最小,分别为0.005和0.014.采用UPGMA法构建的2个系统发生树,南丹分离株和T.spiralis具有高度同源性,位于同一分枝,与无囊包旋毛虫(T.papuae和T.zimbabwensis)分枝较远,后者独成一枝,与T.spiralis相比,2个基因均存在变异,且变异位点均为4个,分别占相应基因序列的1.19%和0.57%.2个基因均富含A和T碱基,A+T含量分别占相应基因的61.8%和66.4%.COX1变异存在转换和颠换,但均发生在密码子第三位点.5SrRNA基因变异位点分散,但变异均为转换,无颠换.结论 南丹旋毛虫分离株与T.spiralis具有高度的亲缘关系,其COX1和5S rRNA基因的碱基组成、变异位点及变异类型均具有偏好现象.

关键词：旋毛虫、COX1、5S rRNA基因、系统发生树

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分类号：R383.15(医学寄生虫学)

资助基金：广西卫生厅医药卫生科研项目96112

在线出版日期：2007-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：516-518,557