蕨类植物叶绿体基因ycf94的分子进化研究

摘要：

ycf94基因是近年来在叶绿体基因组中新发现的一个基因,在蕨类植物中表现高度保守.该研究共选取94种蕨类植物,在系统发育背景下,对ycf94基因的结构特征、密码子偏好性、进化速率和适应性进化进行分析.结果表明,ycf94基因的密码子偏好性较弱,偏好使用以 A/U 结尾的密码子,且不同物种间的偏好性存在一定差异.密码子偏好性的形成主要受到突变压的影响,同时也存在其他因素的作用;基于凤尾蕨科和其他蕨类中ycf94基因的结构特征存在区别,对两者的分子替换速率进行了比较,表明颠换率、非同义替换率和ω值间存在显著差异;仅检测出 1 个正选择位点 74A,强烈的负选择作用表明ycf94基因的结构和功能基本趋于稳定.这为蕨类系统发育分析提供了新依据,并提供了解析ycf94基因功能的线索.

关键词：蕨类植物、ycf94、密码子偏好性、进化速率、适应性进化

所属期刊栏目：31

分类号：Q943.2;S852.65;Q78

在线出版日期：2023-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：541-548