向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析

摘要：

为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute(AGO)和Dicer-like(DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析.结果表明,从向日葵中鉴定到15 个HaAGOs和 5个HaDCLs家族成员;这2 类基因在染色体上的分布均不均匀.系统发育分析表明,与拟南芥相似,HaAGO家族成员可分为3个分支,HaDCL可分为4 个分支;所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域,HaDCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域.表达分析表明,HaDCL3a和HaDCL3b在茎和花序中高度表达;亚细胞定位表明HaAGO多定位于细胞核.这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制,并可能参与了协调向日葵的生长发育过程.

关键词：RNA干扰、AGO家族、DCL家族、向日葵、基因表达

所属期刊栏目：31

分类号：Q943.2;S511;S661.1

资助基金：山西省重点研发计划项目;国家特色油料产业技术体系项目;山西农业大学生物育种工程项目;山西省现代农业产业技术体系建设专项

在线出版日期：2023-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：363-372