基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析

摘要：

为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对168份种质材料进行RAD-seq测序,构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析.结果表明,比对参考基因组平均比对率为81.02％,平均测序深度23.18×,最终获得45552个高质量的SNPs.群体遗传结构分析表明,供试蓝花楹可划分为2个大的类群,来自川、渝地区的种质材料基本归为一类;其余地区归为另一类.19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高,云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)和期望杂合度(He)最大,表现出最高的遗传多样性.因此,来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系,推断来自同一祖先,而其余地区的种质可能是随机引种栽培.

关键词：蓝花楹、RAD-seq、遗传多样性、群体遗传

所属期刊栏目：30

分类号：S823;S917.4;Q959.483

资助基金：中央级公益科研院所专项资金项目;广东省林业科技创新项目

在线出版日期：2022-10-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：613-622