碎米荠超氧化物歧化酶基因家族成员的鉴定和分析

摘要：

为了解碎米荠(Cardamine hirsuta)的SOD基因特征,对SOD家族成员的基因结构、染色体定位、系统进化关系进行了分析,对顺式作用元件和蛋白结构进行了预测,并利用qRT-PCR技术检测各家族成员的组织表达模式.结果表明,碎米荠基因组中共有10个SOD基因(ChSODs),包括6个Cu/Zn-SOD、3个Fe-SOD和1个Mn-SOD.编码的ChSODs蛋白有57～324个氨基酸,分子量为6419.41～34659.01 kDa,理论等电点为4.92～9.60;系统进化树分析表明,碎米荠的ChSOD与拟南芥的AtSOD的同源性较高;ChSODs在根、茎、叶中均有表达,且在叶中高表达,其中CARHR085500和CARHR256690在叶和茎中表达量较高;顺式作用元件预测表明,碎米荠SOD响应多种非生物胁迫,其中对ABA和低温胁迫较为敏感;ChSODs蛋白质的二级和三级结构具有差异性.这表明碎米荠SOD基因在抗氧化过程中发挥重要作用.

关键词：碎米荠、SOD、基因家族

所属期刊栏目：30

分类号：Q786;R74;Q949.363.2

资助基金：硒蛋白产业化关键技术研究与应用项目;湖北省引进国外人才和智力项目

在线出版日期：2022-06-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：301-310