东乡野生稻苗期响应低温胁迫的转录组分析

摘要：

为了解东乡野生稻(Oryza rufipogon)对低温胁迫的响应机制,对苗期的RNA-seq转录表达谱进行了研究.结果表明,与对照相比,共检测到10200个差异表达基因(DEGs),其中5201个上调表达,4999个下调表达,其中有426个DEGs位于已报道的水稻耐冷QTL区间,且37个为耐冷调控相关的家族基因.GO功能分类和KEGG代谢路径分析表明,核酸结合转录因子活性、氨基酸生物合成以及光合作用代谢等均参与响应低温胁迫过程.实时荧光定量分析表明,ABA响应蛋白基因、MYB转录因子和40S核糖体蛋白SA基因等12个可能与低温胁迫响应相关的DEGs表达模式与RNA-seq的一致.可见,植物激素传导途径和转录因子相关调控基因在东乡野生稻苗期响应低温胁迫过程中起重要作用.

关键词：东乡野生稻;低温胁迫;转录组学;耐冷基因

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资助基金：国家自然科学基金项目;江西省自然科学基金重点项目;江西省主要学科学术和技术带头人培养计划项目

在线出版日期：2021-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：616-625