弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析

摘要：

为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征, 选取弯枝藻属 (Compsopogon) 及相近外类群的rbc L基因共17条, 利用PAML 4.9软件, 对弯枝藻属rbc L基因编码蛋白进行生物信息学分析, 并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测.结果表明, 弯枝藻属rbc L基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成, 结构稳定.采用最大似然法构建的系统发育树表明, 内类群为单一物种, 分为3个小分支, 具有一定地理分布规律.在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点, 表明绝大多数位点处于负选择压力下.因此, 弯枝藻属rbc L基因未发生适应性进化.

关键词：弯枝藻属、rbc L基因、蛋白质结构预测、适应性进化

所属期刊栏目：27

资助基金：国家自然科学基金项目31670208,31370239

在线出版日期：2019-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：36-44