橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析

摘要：

为了解橄榄(Canarium album)抗寒相关转录因子ICE1的调控功能,采用RT-PCR技术克隆了'福榄1号'的ICE1,命名为CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析.结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1650 bp,可编码549个氨基酸(GenBank登录号MG459422).CaICE1为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域,定位于细胞核,与枳的ICE1亲缘关系较近.CaICE1密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群.CaICE1主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下CaICE1表达水平比常温显著上升.psRNAtarget预测结果表明,CaICE1可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因.因此,CaICE1可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受miRNA的调控.

关键词：橄榄、抗寒、转录因子、ICE1、克隆、基因表达

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资助基金：福建省属公益类科研院所基本科研专项2018R1013-3, 2016R1013-15;农业部物品种资源保护费热带作物项目151721301354051701

在线出版日期：2018-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：571-579