萝卜-芥蓝异源四倍体植物SR30基因转录本的选择性剪接分析

摘要：

为了解异源多倍体形成后,其剪接因子基因SR30在各组织器官间的表达量以及选择性剪接模式与亲本的差异,选取萝卜-芥蓝异源四倍体(Raphanobrassica)及其亲本萝卜(Raphanus sativus)、芥蓝(Brassica oleracea var.alboglabra)为材料,运用RACE-PCR方法克隆到全长的编码序列(CDS)和3'非编码区(3' UTR),运用qRT-PCR和半定量RT-PCR检测其在各组织器官中的表达量和各转录本表达量间的差异.结果表明,四倍体中萝卜同源的RsSR30基因有5种转录本,芥蓝同源的BoSR30基因有4种转录本.同时,SR30在3物种中的表达具有组织器官的差异,且在四倍体中的总体表达量显著低于亲本.根据克隆到的转录本,预测RsSR30编码3种蛋白,BoSR30编码2种,不同蛋白异构体的区别体现在C末端的丝氨酸-精氨酸富集(RS)结构域.因此,萝卜-芥蓝异源多倍体形成后,SR30基因在表达量和转录本选择性剪接方面都发生了改变.

关键词：异源多倍体、SR30基因、选择性剪接、基因表达、萝卜、芥蓝

所属期刊栏目：24

分类号：S64;S88

资助基金：国家自然科学基金项目31370258

在线出版日期：2016-12-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：535-544