裸子植物psbA基因分子进化式样的研究

摘要：

为阐明裸子植物对陆生生境生态响应的分子机制,以新近的裸子植物分类系统为指导,基于psbA基因编码全序列对4亚纲53种代表植物进行分子进化分析.首先,依据“放松分子钟”模型重建裸子植物在时间尺度下系统发育关系;其次,采用6个模型(MEC/JTT、MEC/cpREV、M5、M7、M8、M8a)估测氨基酸位点ω值,并对各模型结果进行统计检测;随后,利用Bootstrap方法检PSBA蛋白内部氨基酸位点的共进化动态.结果表明,系统树提示的物种分化历程支持前期分类结果;光合系统反应中心核心PSBA蛋白有3个氨基酸位点(13、19和243)曾经受正选择压力;PSBA蛋白内部有多对氨基酸位点间构成了共进化网络.因此,sbA基因编码序列具有作为描绘裸子植物系统发育关系标记的潜力,PSBA蛋白部分位点经历了适应性进化,通过位点间共进化网络协同作用方式辅助裸子植物响应陆生生境.

关键词：裸子植物、响应、机制、放松分子钟模型、适应性进化、共进化

所属期刊栏目：24

分类号：TS7;S78

资助基金：国家自然科学基金青年项目31500260;湖北中医药大学教育部重点实验室科研启动经费5114000914

在线出版日期：2016-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：151-159