药用植物华重楼（黑药花科）叶绿体全基因组研究

摘要：

为探究华重楼(Paris polyphylla var. chinensis)的叶绿体基因组特征，利用叶绿体系统发育基因组学方法，对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明，华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp，由4个区组成，包括2个反向重复区(IRA和IRB，27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC，18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC，85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因，包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cemA基因是假基因，其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列，编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此，华重楼叶绿体基因组比较保守；cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息，其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。

关键词：叶绿体全基因组、华重楼、黑药花科、百合目、cemA假基因化

分类号：S56;R28

资助基金：the National Natural Science Foundation of China Grant 30670132

在线出版日期：2015-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：601-613