巨桉AGO基因家族的生物信息学分析

摘要：

为了解巨桉(Eucalyptus grandis)中Argonaute (AGO)的功能，经全基因组序列分析，巨桉中存在14个AGO基因家族成员，基因长度为2676~3225 bp，编码的蛋白质具有保守的Piwi、PAZ、DUF1785结构域。巨桉EgrAGOs基因可分为3组，内含子和外显子结构具有明显的组织特异性。组内成员核苷酸序列和氨基酸序列保守性较高，同源性分别达到88.14%和82.97%。EgrAGO基因分布于第2、4、7、8、10、11条染色体上，在进化过程中存在着串联复制和大片段基因复制机制。预测巨桉的大部分AGO蛋白定位于细胞核和胞质中，表现出偏碱性和亲水性，具有较高的脂溶指数。基因表达分析表明，桉树EgrAGO成员在不同组织中的表达有明显差异，与木材形成相关的组织/器官中有较高的表达。这些为深入研究EgrAGO基因的功能奠定了基础。

关键词：桉树、AGO蛋白、基因家族、生物信息

分类号：S79;S78

资助基金：国家“863”高技术研究发展计划2013AA102705；国家自然科学基金项目31400554；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项RITFYWZX201304

在线出版日期：2015-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：361-369