10.11926/j.issn.1005-3395.2015.03.003
麻竹miR172a靶基因DlAP2的克隆及其表达
为了解开花麻竹(Dendrocalamus latiflorus)的DlAP2基因功能,采用RT-PCR和RACE技术克隆了miR172a靶基因AP2同源序列cDNA全长,命名为DlAP2。结果表明,DlAP2基因cDNA全长为1729 bp,包含5′端非编码区81 bp、开放阅读框1464 bp、3′端非编码区160 bp和24个碱基的Poly A尾巴,在编码框靠近3′端130 bp处有1个高度匹配miR172a的结合位点(CTGCAGCATCATCAGGATTCT)。DlAP2编码487个氨基酸的蛋白,具有两个AP2结构域,属于AP2/ERF家族AP2亚家族的AP2组,与来自其它单子叶植物的AP2蛋白均有较高同源性。RLM-5′ RACE分析表明,miR172a主要在靶序列的第11~12个碱基之间剪切靶基因DlAP2的miRNA。qRT-PCR结果表明,麻竹花芽中DlAP2基因的表达规律与miR172a表达变化正好相反,证明miR172a对DlAP2基因的表达具有调控作用。
麻竹、AP2基因、miR172a、基因表达
国家林业局948项目2011-4-55
2015-06-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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245-251