基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置

摘要：

为探究适用于马鞭草科植物的DNA条形码及该类群的系统分类关系,对豆腐柴(Premna microphylla)的叶绿体基因ycf6-psbM、trnV-atpE、rbcL、trnL-F、psbM-trnD、atpB-rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rpl36-infA-rps8和核基因ITS序列进行了PCR扩增和测序,结果表明,仅rbcL、trnl-F、trnH-psbA序列的PCR扩增以及测序效果较好,而ITS不能得到明显的扩增条带,ycf6-psbM不能成功测序,其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题.根据DNA条形码标准,rbcL序列是所有测试条码中相对最适合的.应用rbcL和matK序列对马鞭草科(Verbenaceae)豆腐柴属、牡荆属(Vitex L.)、马鞭草属(Verbena L.)和大青属(Clerodendrum L.)等4属与唇形科宝盖草属(Lamium L.)、水苏属(Stachys L.)、鼠尾草属(Salvia L.)和香科科属(Teucrium L.)等4属的分类和系统发育关系进行分析,以紫草科Lithospermum multiflorum L.为外类群,最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树.豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划入唇形科,马鞭草属仍归于马鞭草科,而牡荆属的系统学位置还需更多的证据.

关键词：rbcL、matK、马鞭草科、豆腐柴属、系统学

所属期刊栏目：21

分类号：R28;R93

资助基金：陕西省教育厅科技计划项目2010JK391;陕西省科技厅科技计划项目2011K01-40

在线出版日期：2013-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：116-122