麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究

摘要：

利用麻竹(Dendrocalamus latiflorus)已有的EST序列,开发了一批EST-SSR分子标记,并用于慈竹(Bambusa emeiensis)栽培变异类型的多态性研究.结果表明,在麻竹9574个EST中找到了331个EST,含有381个SSR位点,SSR 出现的频率为3.98％.EST-SSR的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8％,其次是3个核苷酸的重复序列.根据含有SSR的EST序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100～1000 bp,引物有效率达84.1％.遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263～0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’、‘蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远.

关键词：麻竹、EST-SSR、分子标记、慈竹、栽培变异类型、遗传距离

所属期刊栏目：20

分类号：S71;R97

资助基金：林业公益性行业科研专项201004005

在线出版日期：2012-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：462-468