中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性

摘要：

从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得48501条中国板栗(Castanea mollissima)EST序列,其中8479条EST含有12116个长度大于10 bp的SSR,EST-SSR的出现频率为24.98%.二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗EST-SSR最主要的重复类型,分别占总数的38.05%和42.20%.对中国板栗EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)的通用性检测表明,677对中国板栗EST-SSR引物皆能扩增,证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性.115个位点的多态性分析表明,中国板栗、茅栗和锥栗分别有106、108和101个位点表现出多态性.在575个等位基因中,有260个(45.22%)是3物种的共有等位基因,各物种都有各自特有的等位基因.这项研究为中国栗属植物EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础.

关键词：中国板栗、EST-SSR、栗属、通用性

所属期刊栏目：18

分类号：Q347(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金项目30770219;中国科学院重要方向性项目KSCX2-YW-N-061

在线出版日期：2011-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：665-669