甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析

摘要：

利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotide binding site)序列中的保守模体(motif)"P-loop"和"GLPL"合成简并引物,以甘薯(Ipomoea batatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistance gene analogues,RGAs)序列,它们之间核苷酸序列间的相似性系数在41.2%-99.4%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在20.6%-100%之间,同时对分离的RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明甘薯RGAs可分为TIR(Drosophila Toll or human interleukin receptor-like)和nonTIR两类.对甘薯RGAs和5个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括"P-loop"、"Kinase-2"、"Kinase-3a"、"GLPL"4个抗病基因所共有的保守模体.这些表明甘薯与其它物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制.

关键词：甘薯、NBS、抗病基因类似物、基因分离、序列分析

所属期刊栏目：14

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：国家自然科学基金30370900;福建省科技计划项目2003N001

在线出版日期：2006-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：359-365