球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)叶绿体psaA基因片段的序列分析

摘要：

根据GenBank中检索到的南极棕囊藻(phaeocystis antarctica)psaA基因序列设计psaAL和psaAR引物,对球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)的psaA基因片段进行PCR扩增并测序,获得了629bp的DNA序列.应用Clustal X对球形棕囊藻P1、P2株系和南极棕囊藻的psaA基因片段序列进行比对,结果表明,球形棕囊藻psaA基因片段序列无插入/缺失,核苷酸差异率为3.34%.应用DNAstar分析软件推断球形棕囊藻和南极棕囊藻的psaA基因对应的氨基酸序列和RNA二级结构,发现它们的氨基酸序列差异不大,序列中209个氨基酸只有1个发生了变化,其氨基酸变异率为048%;除部分结构域比较相似外,RNA二级结构上体现一定程度的差异,这可能对棕囊藻的分子分类研究有参考价值.因所获得的psaA基因片段序列及氨基酸序列具有种的极端保守性,不适宜用作Phaeocystis属种间的分子分类研究.

关键词：球形棕囊藻、南极棕囊藻、psaA基因、DNA序列、氨基酸序列、RNA二级结构、藻类

所属期刊栏目：12

分类号：Q949.261(植物学)

资助基金：国家自然科学基金40106014;广东省自然科学基金000760

在线出版日期：2004-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：435-439