白羽扇豆WRKY转录因子家族鉴定及生物信息学分析

摘要：

WRKY转录因子家族在植物生命活动中具有重要作用.利用生物信息学方法分析白羽扇豆基因组数据,对LaWRKY转录因子家族成员进行鉴定及染色体定位,同时分析其蛋白理化性质、系统发育进化关系、保守基序分布、保守结构域位置、基因结构及启动子-顺式作用元件等,并从系统发育进化的同源性、启动子-顺式作用元件等多角度对LaWRKY转录因子功能进行预测.结果表明,在白羽扇豆中共鉴定到106个LaWRKY转录因子家族成员,各成员不均匀地分布在24条染色体上,但18号染色体上无分布;106个成员聚类为3个亚族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),各亚族成员的保守基序分布相似,对应的保守结构域、基因结构特征也表现一定的规律性,多角度预测到LaWRKY转录因子与植物激素、环境变化等方面有关联.本研究为深入解析LaWRKY转录因子对白羽扇豆生命活动的调控作用提供理论参考.

关键词：白羽扇豆、基因组、WRKY转录因子、生物信息学

所属期刊栏目：42

分类号：Q943.2(植物学)

在线出版日期：2023-02-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：42-53