菠萝蜜AhSS2基因克隆及生物信息学预测

摘要：

蔗糖合成酶(sucrose synthase,SS)作为催化蔗糖代谢的关键酶之一,能够参与蔗糖的代谢和运输,调节细胞分化与细胞壁的形成,对调控作物的品质和产量也有重要作用.克隆出菠萝蜜AhSS2基因并对其进行生物信息学分析.菠萝蜜AhSS2基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)全长2436 bp,共编码811个氨基酸,其蛋白理化性质预测显示,相对分子量是92.583 ku,等电点pI为5.77,属亲水性酸性蛋白质,二级结构主要为Alpha helix(α-螺旋).保守结构域分析显示,菠萝蜜AhSS2基因属于PLN00142超级家族成员,主要包括蔗糖合成酶结构域(Sucrose_synth)与糖基转移酶结构域(Glycos_transf_1)2个保守结构域.磷酸化位点预测显示,菠萝蜜AhSS2基因蛋白的磷酸化位点主要是丝氨酸(Ser)磷酸化位点.系统发育树分析显示,菠萝蜜AhSS2基因在分类上属SSⅡ.本研究为进一步研究菠萝蜜蔗糖合成酶家族成员的功能提供依据.

关键词：菠萝蜜;蔗糖合成酶;生物信息学;系统进化分析

所属期刊栏目：41

分类号：S667.8(果树园艺)

资助基金：广东海洋大学创新强校工程科研项目;广东海洋大学创新强校工程科研项目;广东海洋大学创新强校工程科研项目

在线出版日期：2022-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：89-95