甘蔗新基因ShUGT2的生物信息学分析及亚细胞定位

摘要：

UDP-糖基转移酶在植物体内负责糖基化修饰,对植物的生长发育起着关键作用.以甘蔗品种ROC22为供试材料,提取成熟叶片总RNA并反转录合成cDNA,经PCR扩增获得ShUGT2基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学、亚细胞定位和组织特异性表达分析.结果表明:ShUGT2含有1782 bp的完整开放阅读框,编码593个氨基酸,其编码蛋白与高粱UDP-糖基转移酶同源性达到92.45％.ShUGT2编码蛋白不稳定系数为48.68,疏水性指数-0.338,是一种亲水性蛋白;在20～42个氨基酸的位置,有一个跨膜区;在309～514个氨基酸,存在UDP-糖基转移酶的家族特异保守结构域,属于GT8家族成员,其功能是通过合成木聚糖,调控细胞内半纤维素成分,维持植物的生长发育.亚细胞定位分析表明,ShUGT2编码蛋白定位于线粒体;在甘蔗的根、茎、叶组织中,ShUGT2基因均有表达,与甘蔗的生长发育密切相关.本研究结果为进一步分析ShUGT2基因功能提供了科学依据.

关键词：甘蔗、UDP-糖基转移酶、基因克隆、生物信息学分析、亚细胞定位

所属期刊栏目：41

分类号：S435.661(病虫害及其防治)

资助基金：高层次人才项目;岗位科学家项目;基本科研业务费项目

在线出版日期：2021-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：25-32