'航花2号'的△12脂肪酸脱氢酶(FA D2)基因的生物信息学分析

摘要：

植物中的Δ12脂肪酸脱氢酶(FA D2)是油酸形成亚油酸的关键酶.通过NCBI和EXPASY 2大数据库,采用SignalP﹑TMHMM﹑Psort﹑ProtParam和TargetP等分析程序对花生品种'航花2号'及其它物种的19个FAD2蛋白序列进行分析,利用MEGA6.0软件比对序列及构建系统进化树阐明FA D2基因的系统发育关系,亲缘相近的FAD2蛋白聚在一起.预测了'航花2号'和'粤油13'的FAD2蛋白的分子质量﹑ 等电点﹑ 信号肽﹑ 跨膜和保守结构域等.结果表明:'航花2号'FAD2蛋白的N端没有信号肽,预测定位在微体﹑ 细胞质﹑ 线粒体基质和叶绿体类囊膜中,而C端信号基序LKGL使得FAD2蛋白选择性地结合和嵌入内质网,植物的FAD2蛋白普遍有3个高度保守的组氨酸富集基序(HECGHH﹑HRRHH和H[A/C/T]HH)和3~5个跨膜结构,但分析结果显示,'航花2号'的FAD2蛋白的H[A/C/T]HH的组氨酸基序是缺失的,而油酸转化为亚油酸的效率上并没有显著变化,为将来FA D2基因的基因工程操作提供一定的理论基础.

关键词：花生、脂肪酸脱氢酶、生物信息学、油料作物

所属期刊栏目：37

分类号：Q946.81(植物学)

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-14;广东省科技厅公益研究与能力建设项目2016B020201003;广东省农业厅农业技术需求研究与示范项目2016LM3161﹑ 2016LM3164;广东省科技厅应用型科技研发专项资金项目2000;广东省自然科学基金2015A030313565;国家自然科学基金青年科学基金项目31501246

在线出版日期：2017-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：38-44