一个木薯候选STK类抗病基因的分离及其生物信息学分析

摘要：

根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(STK)结构域Ⅰ和Ⅷ氨基酸保守序列设计了1对简并引物,以细菌性萎蔫病抗/感木薯种质E1340和GR911基因组DNA为模板,通过PCR扩增,均获得大小约0.5 kb的扩增片段。两个片段纯化、克隆、测序后获得完全一致的505 nt序列,比对发现,木薯种质AM560带有和该序列高度同源的核苷酸片段。对包括同源片段上下游各约2.0 kb的大片段序列进行基因预测,获得1个有4个外显子、 ORF全长1866 nt的预测基因,命名SSK1。序列分析表明,该基因编码621 aa,有细胞壁受体激酶结合、偶联位点和8个跨膜结构域,具有典型的STK类抗病基因的保守结构,是一个候选的抗病基因,可能在木薯抗病反应中发挥重要作用。

关键词：木薯、候选抗病基因、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶

所属期刊栏目：36

分类号：S533(薯类作物)

资助基金：农业部现代农业人才支撑计划项目No.0316001；国家木薯现代产业技术体系建设项目No.CARS-12-hnhgx；海南省自然科学基金No.20153046。

在线出版日期：2017-02-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：27-32