巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析

摘要：

钙/钙调素依赖型蛋白激酶(CCaMK, calcium- and calmodulin-dependent protein kinase)是一种钙离子结合蛋白,在钙信号传导过程中起重要作用。本研究以已发表的CCaMK序列作为检索序列,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,鉴定得到6个CCaMK基因,其中包括一个橡胶树CCaMK基因,命名为HbCCaMK1。序列分析发现：5种植物的CCaMK氨基酸序列同源性较高,为73%～94%。基因结构分析发现, HbCCaMK1和所分析的其他植物CCaMK一样均,含有6个内含子、1个蛋白激酶结构域和3个EF-hand结构域；从结构和进化上看, HbCCaMK1和蓖麻、木薯2种植物的CCaMK具有较近的亲缘关系；在表达方面, HbCCaMK1在橡胶树根中表达丰度最高,其次为树叶和花；另外, HbCCaMK1的表达还与叶片发育、真菌侵染和低温胁迫有关。

关键词：巴西橡胶树、CCaMK、基因家族、结构与进化、表达分析

所属期刊栏目：36

分类号：S794.1(森林树种)

资助基金：国家自然科学基金项目No.31400565。

在线出版日期：2017-02-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：16-20