巴西橡胶树β-木糖苷酶基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

以巴西橡胶树根为材料,利用RT-PCR技术从总RNA中捕获到一个β-木糖苷酶家族基因(β-xylosidase或β-D-xyloside xylohydrolase, EC 3.2.1.37), cDNA长度2880 bp,开放阅读框2319 bp,编码773个氨基酸,命名为HbEC32。在HbEC32氨基酸序列中具有一个较强的跨膜区,二级结构分析表明其属于混合型蛋白。HbEC32在N端前8～20氨基酸区域内为较强的疏水区,但整条多肽链表现为亲水性。对15个β-木糖苷酶蛋白进行系统进化分析发现,巴西橡胶树的HbEC32基因与蓖麻亲缘关系最近。

关键词：巴西橡胶树、HbEC32、基因克隆、序列分析

分类号：S794.1(森林树种)

资助基金：海南省自然科学基金No.313062。

在线出版日期：2014-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：51-55