假臭草EST-SSRs标记的开发

摘要：

从NCBI的dbEST数据库中下载假臭草同族植物的EST序列，经EST序列处理及SSR位点查询，首次设计了27对假臭草EST-SSRs引物，以海南省文昌市假臭草 DNA为模板，采用单因素和L16(45)正交试验对其EST-SSRs PCR反应体系进行优化。建立了假臭草EST-SSRs最佳20μLPCR反应体系： Mg2+浓度为2.75 mmol/L，模板DNA用量为35 ng， Tag DNA聚合酶为2.25 U， dNTPs浓度为0.3 mmol/L，引物浓度为0.6μmmol/L。并用14个不同来源的假臭草样本对其体系进行验证实验，结果均能获得稳定的、清晰明亮的扩增谱带。假臭草EST-SSRs 标记的开发为深入研究其遗传多样性提供了基础。

关键词：假臭草、EST-SSRs、引物设计、优化

分类号：Q754;S451(分子遗传学)

资助基金：国家标本平台教学标本子平台No.2005DKA21403-JK；华侨大学2012年实验教学改革与建设课题No.66661220Y；福建省自然科学基金项目No.2010J05076。

在线出版日期：2014-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：27-33,44