两种软珊瑚EST-SSR通用性引物的研发

摘要：

基于短指软珊瑚(Sinularia ceramensis)和花环肉质软珊瑚(Sarcophyton ehrenbergi)转录组数据,比较了上述两种软珊瑚转录组SSR序列的差异.利用合成的100条EST-SSR引物和4属11种30株软珊瑚样本进行通用性筛选.研究表明,在短指软珊瑚和花环肉质软珊瑚转录组数据中分别检测到2 914个和2 335个微卫星,两种软珊瑚最多的重复类型均为三核苷酸序列重复,优势重复基元均为TA/AT.筛选出8对扩增稳定的EST-SSR引物,Sinularia 属和 Sarcophyton 属的扩增率分别为 87.50％和 96.43％,Aldersladum 属的扩增率为56.25％,Lobophytum 属的扩增率为37.50％.这8对种属间通用性较好的EST-SSR标签序列能为今后软珊瑚多样性研究提供借鉴.

关键词：短指软珊瑚、花环肉质软珊瑚、转录组测序、EST-SSR、通用性

所属期刊栏目：30

分类号：Q953+.1;Q178.53(动物学)

资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目;国家级大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-05-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：17-24