海南短指软珊瑚全基因组测序初步分析

摘要：

以Sinularia软珊瑚为研究对象,用Covaris超声波破碎仪随机将其DNA样品打断成长度为350 bp的片段,构建好的文库通过Illumina Nova Seq进行PE测序.结果表明:软珊瑚Sinularia ceramersis Verseveldt基因组大小为649.58 Mbp,杂合率为1.25％,重复序列比例为57.06％.采用kmer =43进行初步组装,得到contig N50为836 bp,总长为586.07 Mbp,scaffold N50为1 044 bp,总长为599.11Mbp.结果显示,Sinularia ceramensis Verseveldt的基因组为1个复杂的基因组,需要采用相应的策略进行基因组组装.

关键词：基因组测序、Sinularia软珊瑚、基因

所属期刊栏目：27

分类号：Q75;Q178.53(分子遗传学)

资助基金：三亚市院地科技合作项目2017YD01

在线出版日期：2020-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-5,26