海南短指软珊瑚msh1基因的系统进化

摘要：

为了在分子水平上对海南短指软珊瑚进行分类与鉴定,以海南15份短指软珊瑚(Sinularia)与结合Genbank种搜索到的Sinularia种msh1基因序列进行系统进化树构建分析.结果在msh1碱基比对中发现,所有海南样品与澎湖指形软珊瑚(S.penghuensis)、西沙短指软珊瑚(S.notanda)和南海圆形短指软珊瑚(S.brassica)亲缘关系较远.在已知种中,可以得出西沙短指软珊瑚(S.notanda)种分化时间最早.样本S126 msh1和S.polydactyla序列相同,则为多型短指软珊瑚(S.polydactyla);样本S121 msh1和S.cruciata序列相同,则为台湾海域软珊瑚(S.cruciata);样本S088 msh1与S.verseveldti序列相同,则为S.verseveldti;样本S193 msh1与S.flexibilis序列相同,则为弱软短指软珊瑚(S.flexibilis);样本S035msh1与S.abrupta(JX991168.1)序列相同,则为S.abrupta.样本S053 msh1和S.crassa与S.finitima亲缘关系相近;样本S010 msh1、S118 msh1、S168 msh1、S100 msh1、S031 msh1和S.abrubta(FJ621374.1)与西沙短指软珊瑚(S.molesta)和思氏指形软珊瑚(S.slieringsi)亲缘关系最近,因此这些海南样本都为Sinularia.sp.

关键词：短指软珊瑚、msh1基因、进化树

所属期刊栏目：26

分类号：Q75;Q178.53(分子遗传学)

资助基金：海南重大科研专项ZDKJ2016009-03;三亚市院地科技合作项目2017YD01;琼州学院国家级大学生创新创业训练项目201711100009

在线出版日期：2019-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：18-22