CDK1基因在肝癌预后和免疫细胞浸润的生物信息学分析

摘要：

目的 通过生物信息学方法研究细胞周期素依赖性激酶 1(Cyclin-dependent kinase 1,CDK1)在肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达差异,探索其在肝癌预后和免疫细胞浸润间的作用.方法 从GEO数据库下载肝癌数据集,使用 R软件分析差异基因,并取交集基因;通过 GO 和KEGG分析富集通路;使用STRING和cytoscape构建差异基因互作网络,结果可视化获取核心基因CDK1;UALCAN和GEPIA数据库分析肝癌中CDK1 的表达水平,及其与临床特征的关系;HPA数据库分析CDK1蛋白在肝癌组织和正常组织的表达差异;通过Kaplan-Meier Plotter 分析CDK1 表达水平与HCC预后的关系;TIMER数据库分析CDK1 与HCC肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞表面标记物的相关性.结果 3 个肝癌数据集筛选出共有的 347 个差异基因;KEGG 通路显示差异基因主要参与细胞周期通路;与正常组织相比,CDK1 基因在HCC组织中表达水平升高;CDK1 高表达与肿瘤分期、年龄均有相关性;生存分析结果表明CDK1 基因高表达患者生存时间明显低于低表达患者.CDK1 基因与HCC中多种免疫细胞浸润水平及其表面标记物显著相关.结论 CDK1 基因在HCC中表达上调,高表达的CDK1 肝癌患者预后不良,并且影响HCC免疫浸润水平.CDK1 基因可能为HCC 新的免疫治疗靶点.

关键词：肝癌、预后、免疫浸润、生物信息学、CDK1

所属期刊栏目：44

分类号：R575(消化系及腹部疾病)

资助基金：山西医科大学汾阳学院校级科研项目;山西医科大学汾阳学院校级科研项目

在线出版日期：2023-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：201-209