10.3969/j.issn.1002-1256.2022.24.002
KLRB1表达与头颈部鳞状细胞癌免疫浸润及临床相关性分析
目的 应用生物信息学的方法探讨杀伤细胞凝集素样受体B1(Killer cell lectin-like receptor subfamily Bmember 1,KLRB1)在头颈部鳞状细胞癌(Head and neck squamous cell carcinoma,HNSC)中的表达,并分析KLRB1表达与HNSC临床相关性及免疫浸润的关系.方法 使用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和GTEx数据库来分析KLRB1表达水平与泛癌之间的关系;用TCGA数据分析KLRB1在肿瘤与正常组织及配对癌旁组织的差异;通过基因表达综合(GEO)数据库的数据集GSE6631验证KLRB1在HNSC中的表达水平;受试者工作特征曲线(ROC)评估KLRB1是否可以作为一种潜在的诊断生物标志物;COX回归用于确定与HNSC患者预后相关的因素;通过STRING来构建KLRB1结合蛋白网络;使用R语言进行富集分析来探索KLRB1在HNSC的潜在功能;来自R包GSVA和TIMER数据库的单样本ssGSEA用于研究HNSC中免疫浸润水平与KLRB1表达及预后之间的关系.结果 泛癌分析结果表明,KLRB1在大多数癌症中差异表达,其中在HNSC中表达降低;对数据集GSE6631的分析也表明KLRB1在HNSC中表达降低;ROC曲线表明KLRB1可能是HNSC的一种潜在的诊断生物标志物(AUC=0.629);KLRB1的高表达与较好的总体生存期有关(P=0.001);富集分析和免疫浸润分析表明KLRB1与T细胞的调节及多种免疫细胞的浸润水平有关.结论 KLRB1在HNSC的表达低于正常组织,且KLRB1的表达与HNSC的预后和免疫浸润有关.因此,KLRB1有潜力成为HNSC的预后生物标志物.
头颈部鳞状细胞癌、预后、免疫浸润、KLRB1
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R739.91(肿瘤学)
安徽省高校自然科学基金重点项目KJ2017A273
2023-02-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
2305-2312