基于生物信息学分析艾滋病患者血中相关差异基因

摘要：

目的 基于生物信息学方法筛选艾滋病(AIDS)相关的关键基因,为后续生物学功能研究提供分子靶标.方法 通过GEO数据库下载基因芯片GSE140713,筛选AIDS患者血样与健康对照血样的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并且通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),确定其中与AIDS发生发展密切相关的关键基因.结果 GEO数据分析结果显示,AIDS共有1770个DEGs(1128个上调基因,642个下调基因).GO富集分析结果显示,DEGs主要参与DNA结合转录激活活性、信号受体激活物活性等分子功能.KEGG通路富集分析结果显示,DEGs主要富集于NOD样受体信号通路.经过构建PPI网络分析其重要的功能模块及其关键基因,结果鉴定出5个关键基因可能与AIDS的发生发展相关.结论 本研究筛选出人AIDS血液中5个关键基因(CDK1、BUB1、CCNA2、CCNB1、KIF11),它们可能成为AIDS病毒潜伏期治疗的潜在靶点.

关键词：AIDS、差异表达基因、关键基因、潜在靶点

所属期刊栏目：43

分类号：R512.91(传染病)

资助基金：云南省教育厅科学研究基金项目2022J1536

在线出版日期：2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1815-1820