基于生物信息学分析α-肌动蛋白1在胃癌中的表达情况及临床意义

摘要：

目的 分析ACTN1基因在胃癌组织和癌旁正常组织中的表达差异,探讨其与胃癌免疫浸润水平、预后的相关性及其可能的信号通路及互作蛋白.方法 通过TCGA、GEO数据库分析ACTN1在胃癌组织及癌旁正常组织中的表达差异;通过Kaplan-Meier数据库分析ACTN1与胃癌患者预后的相关性;通过Timer与TISIDB数据库分析ACTN1与胃癌免疫浸润水平的相关性;通过cBio-Portal数据库获取ACTN1在胃癌中的共表达基因,并对ACTN1及共表达基因进行GO及KEGG富集分析;通过String数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络并筛选Hub基因,分析ACTN1与Hub基因的相关性.结果 ACTN1基因在胃癌组织中呈现高表达;ACTN1高表达的胃癌患者总体生存率与低表达患者相比显著降低;胃癌组织中ACTN1表达量与巨噬细胞、中央记忆CD4+T细胞、效应CD4+T细胞、浆细胞样树突状细胞呈正相关,与活化CD4+T细胞呈负相关;GO及KEGG分析显示ACTN1及共表达基因可能通过参与细胞外基质组织、细胞外结构组织、细胞连接组装等生物学过程,并与FN1、FERMT2、ITGB5、FLNA、ITGAV、ITGB1、ILK、ITGA5、PARVA等基因表达密切相关.结论 ACTN1基因与胃癌患者的不良预后及肿瘤免疫浸润水平密切相关,可作为一个潜在的用于诊断及预后评估的分子生物学标志物.

关键词：胃癌、α-肌动蛋白1、ACTN1、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：蚌埠医学院研究生科研创新计划项目Byycx21073

在线出版日期：2022-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：406-411