病毒性肝炎肝硬化发病关键基因及相互作用的生物信息学研究

摘要：

目的 筛选病毒性肝炎肝硬化发生发展中的关键基因,分析其相互之间的作用.方法 本研究从公共基因芯片数据库(GEO)下载病毒性肝炎肝硬化相关芯片数据,利用R语言中相关软件筛选出表达差异基因,分别对差异基因进行Gene Ontology功能分析、KEGG代谢通路分析以及蛋白相互作用网络分析.结果 本研究从GEO数据库中筛选出2组基因芯片进行分析,发现共同差异基因307个,其中上调基因62个、下调基因245个.富集分析表明差异基因在信号传导、免疫反应等方面与肝硬化的发生发展有关,通过粘着斑通路、细胞黏附分子通路有关影响其进程;并筛选得到HLA-DMA、MYL9、COL3A1、C1QA等28个与肝硬化发病关系密切的基因、构建了相应的蛋白相互作用网络.结论 利用生物信息学方法能有效的分析基因芯片数据、筛选出目标基因,为病毒性肝炎肝硬化的防治、诊断和治疗等提供新的思路和相关靶点.

关键词：病毒性肝炎、肝硬化、基因芯片、生物信息

所属期刊栏目：40

分类号：R575(消化系及腹部疾病)

资助基金：蚌埠医学院科技发展基金项目BYKF1759;蚌埠市级科技创新指导类项目20160312

在线出版日期：2019-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2387-2391