鼠视网膜VEGF家族靶点基因相关性分析

摘要：

目的 比较鼠视网膜Vegf家族几个主要目标基因之间功能和作用途径的异同.方法 利用Genenetwork数据库中BXD鼠基因数据对两类抗VEGF药物作用的小鼠Vegf家族靶点基因进行分析比较.采用基因表达水平、目标基因间比较、与目标基因相关的基因间比较、表达量性状位点(eQTL)等多种方法和统计策略,对C57BL/6J XDBA/2J(BXD)重组小鼠近交系(RI)群体的视网膜全基因组表达谱数据中Vegf家族不同靶基因(VegfA、VegfB、VegfC和Pgf)的分子通路或潜在功能的异同进行了比较和研究.结果 VegfA2在所有VegfA三个基因探针中的表达水平最高.在总体比较中,VegfA1和VegfA2的表达水平呈正相关(r=0.541),VegfB与VegfC之间的相关性较弱(r=0.360),VegfC与Pgf的表达水平也呈弱相关性(r=0.324).在进一步对目标基因高度相关基因间的比较中,各基因最为相关的50个基因与其他基因之间相互关系均较弱.r值之间的比较中,VegfB与VegfA2之间呈现负相关性(R50ab=0.3129,R50ba=-0.42758),VegfC与VegfB之间呈现密切相关性(R50cb=0.8648),与VegfA2也呈正相关(R50ca=0.4514),Pgf与VegfB、VegfC之间均呈现一致正相关性,同时大多数的50p基因与VegfA2之间呈现负相关性.结论 鼠视网膜Vegf家族中的目标基因之间表达水平和正负相关性各不相同,提示这些基因可能通过不同的途径发挥其作用,对于在治疗新生血管性疾病中应用多基因靶点药物对VEGF的抑制效果或将优于单基因靶点药物.

关键词：VEGF、Genenetwork数据库、eQTL、RI小鼠、基因组学、单克隆抗体、受体融合蛋白

所属期刊栏目：40

分类号：R774(眼科学)

资助基金：黑龙江省卫生计生委科研课题2017-294

在线出版日期：2019-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2116-2120