MiR-30靶向BECLIN1在胃癌中的作用及其机制研究

摘要：

目的 基于二代测序技术分析胃癌组织中miRNA-30的表达差异,采用生物信息学方法 分析其靶基因及相关功能注释和信号通路富集,以期揭示miRNA-30在胃癌中的诊断价值及临床意义.方法收集2015年9月—2016年12月本院住院胃癌患者60例和同期对照健康人群50例标本,用高通量测序技术检测其中3例胃癌及癌旁组织中差异表达的miRNA,利用R 3.4.0软件绘制热图,并用荧光定量PCR(qPCR)验证miRNA-30和beclin1的差异表达.应用miRBase数据库预测miRNA-30的靶基因.利用cytoscape 3.5.1及其插件ClueGO进行GO(gene ontology)富集,利用DAVID数据库进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信号通路注释.利用miRNet数据库绘制miRNA-30与mRNA表达调控网络.结果 二代测序结果显示,胃癌组织中miRNA-30表现为下调.qRT-PCR验证支持这一结果(P<0.001).GO功能注释主要富集于MAPKK活性、干细胞发育、STAT蛋白酪氨酸磷酸化的调控、蛋白质磷酸化氨基酸结合、酪氨酸磷酸化肽、调节脂质激酶活性、磷蛋白聚合、核转录mRNA聚A尾缩短等生物学过程和分子功能(P<0.01);KEGG信号通路富集主要涉及TP53基因调节细胞死亡基因的转录、TOR信号通路、Wnt信号通路、Hippo信号通路中(P<0.01).调控网络表明miRNA-30参与包括beclin1在内的多种靶基因的直接调控.结论 miRNA-30在胃癌组织中表达水平下调,作为胃癌的抑癌因子,miRNA-30的靶基因、功能注释和信号通路注释富集于与消化肿瘤相关的生物信息中.

关键词：胃癌、miRNA-30、beclin1、作用机制

所属期刊栏目：39

分类号：R573(消化系及腹部疾病)

资助基金：山西省自然基金2015021185;长治医学院普及项目QDZ 201502 G4;the Natural Science Foundation of Shanxi Prorince2015021185;Changzhi Medical college popularization ProgramNo. QDZ201502 G4;长治医学院大学生创新创业训练计划项目 D2017017

在线出版日期：2018-06-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：380-383