基于m6A甲基化调控因子文献信息构建食管癌预后风险模型

摘要：

目的 构建基于m6 A甲基化调控因子的食管癌预后风险模型,并寻找预后生物标志物.方法 从TCGA数据库下载食管癌转录组数据和临床资料,提取m6 A甲基化调控因子基因表达数据,利用R软件"limma"包进行差异表达分析,采用单因素Cox回归分析筛选预后有关联的m6A调控因子,多因素Cox回归分析构建食管癌预后风险模型.基于模型计算每位患者的风险评分,并根据风险评分的中位数将患者分为高、低风险组,采用Kaplan-Meier生存分析和ROC曲线对模型效能进行评价.结合临床病理特征,采用Cox回归分析验证该模型在食管癌预后评估中的有效性.结果 差异表达分析显示,ALKBH5、KIAA1429、RBM15、YTHDF1、HNRNPC、METTL3、WTAP、YTHDF2和YTHDC1在食管癌组织中高表达,单因素分析结果显示过高表达ALKBH5(HR=0.953,95％CI为0.920～0.987,P=0.01)的食管癌患者预后较好,多因素分析,变量筛选方法选用LR向后剔除法,构建包含4个基因的预后风险模型,Ka-plan-Meier生存分析显示高风险组5年总生存率较低风险组差(χ2=5.53,P=0.02),ROC曲线提示模型预测性良好(AUC=0.759).模型风险评分及临床病理特征纳入Cox回归分析,结果显示高风险评分是食管癌患者预后的唯一独立危险因素.结论 采用生物信息学法构建的食管癌预后风险模型,预测能力较好,并确定了一个保护性生物标记物ALKBH5.

关键词：食管癌;m6A甲基化;预后模型;预后生物标志物;生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：重大疑难疾病中西医临床协作试点项目2019-ZX-005

在线出版日期：2022-01-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1471-1476